Sirens สิ่งมีชีวิตต่างดาวที่มาจากอนาคตแสนไกล ที่มาของพวกเธอเหล่านั่นยังไม่เป็นที่แน่นอน ได้มาเยือนโลกในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง มอบพลังให้ทั้งสองฝ่าย Crimson Axis (ฝ่ายอักษะ) และ Azur Lane (ฝ่ายสัมพันธมิตร) โดยอิงจากประวัติศาสตร์จริง ๆ ในสงครามโลกครั้งที่สองโดยพลังที่ Sirens มอบให้เป็นพลัง นั่นคือ Wisdom Cube ไอเทมที่จะให้เราสร้างเรือได้ภายในเกมนั่นเอง ฝ่าย Azur Lane ได้รับพลังและใช้มันอย่างไม่เต็มใจ แต่ต้องใช้มันเพื่อปกป้องความสงบสุข และต่อกรภัยจากต่างโลก โดยให้ทำงานร่วมกับมนุษย์ให้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ Azur Lane ในส่วนของฝ่าย Crimson Axis เชื้อพลังที่ได้รับมาจาก Sirens และเหล่าสัตว์ประหลาดจะสามารถนำไปใช้ปกป้องมวลมนุษย์ได้ ดังนั้นฝ่ายนี้จะให้สัตว์ประหลาดทำงานร่วมกับอาวุธที่ Sirens มอบให้มา Sirens ไม่มีได้มีทีท่าจะโจมตีมนุษย์หลังจากมอบพลังให้ แต่จะให้มนุษย์หลงใหลพลังที่ได้รับมา และเฝ้าดูมนุษย์อยู่ห่าง ๆ ทั้งสองฝ่ายได้สร้างสาวน้อยที่เกิดจากเรือรบขึ้น โดยมีต้นแบบจาก Sirens มนุษย์ต่างดาวที่มอบพลังให้พวกเขา ทั้งสองฝ่ายได้ต่อสู้กัน และสงครามในรูปแบบใหม่จงถือกำเนิดขึ้น
