เมื่อภัยร้ายจากแม่มดไม่ยอมสิ้นสุดโดยง่าย ทำให้เหล่านักเรียนยมทูตฝึกหัดจึงต้องมีกลุ่มเด็กรุ่นถัดไป เข้าสานต่อการต่อสู้เพื่อปกป้องความสงบสุข ในภาคต่อจากอนิเมะชื่อดังซึ่งมาคราวนี้สดใสยิ่งกว่าเดิมใน Soul Eater Not!” เป็นเวลานานนับหลายทศวรรษจากความกลัวที่ทำให้เหล่ามนุษย์ต้องหวาดหวั่นมาอย่างยาวนาน เหล่าความชั่วร้ายที่แฝงการอยู่ในคราบของ “แม่มด” ซึ่งคนธรรมดาไม่อาจต่อกรกับอำนาจแห่งศาสตร์มืดของพวกมันได้ ดังนั้นจึงได้มีการจัดหาผู้ที่มีความสามารถในการจักการกับเหล่าแม่มดได้ นั่นก็คือ เหล่ายมทูต รัฐเนวาดา ในเมืองเดธซิตี้ (Death City ) มีสถานที่แห่งหนึ่งชื่อ “ซิบุเซ็น” (Shinigami Buki Shokunin Senmon Gakkō) โรงเรียนฝึกหัดยมทูต การฝึกสอนเหล่ายมทูตของที่นี่ จะเริ่มต้นจากระดับชั้นที่เรียกว่า NOT Class (Normally Overcome Target Class=จะตกเป็นเป้าหมายในยามปรกติ) เพื่อฝึกทักษะการใช้อาวุธ การแปลงร่าง และเรียนรู้การควบคุมพลัง ก่อนนำไปใช้ในการต่อสู้จริงซึ่งเป็นระดับชั้นสูงขึ้นอีกขั้นที่เรียกว่า EAT class (Especially Advanced Talent Class=ความสามารถที่พิเศษอย่างเทียบไม่ได้) ครั้งหนึ่ง… โลกมนุษย์เกือบเคยถึงวาระสุดท้ายจากปีศาจที่ถูกเรียกว่า คิชิน (Kishin = Evil Demon Gods) ซึ่งเวลานี้มันถูกผนึกอยู่ใต้ดินของชิบุเซ็น ทว่า… ภัยมืดจากพวกเทลย์เตอร์ (Traitor) ยังไม่หยุดที่จะคุกคามมนุษย์ด้วยการสร้างความหวาดกลัว แม่มดคนใหม่ผู้เป็นน้องสาวคนเล็ก หนึ่งในสามพี่น้องกอร์กอน ผู้มีสัญลักษณ์รูปแมงป่อง ได้เริ่มแผนการร้ายขึ้น